Serial dotyczy ryzykanej misji Nicka Fury'ego i Talosa, którzy odkrywają wieloletnią infiltrację Ziemi przez Skrulle - zmiennokształtne istoty. Agenci starają się zdemaskować ukrytych wrogów, zanim ci zdążą zrealizować swoje tajemnicze plany i zdestabilizować świat. Napięcie rośnie w miarę jak Fury i Talos odkrywają, że Skrulle są wszędzie, a zaufanie staje się towarem deficytowym. Czy uda im się powstrzymać inwazję, nie zdradzając przy tym ziemskich sojuszników