Serial opowiada o losach Phila Coulsona, który po wydarzeniach znanych z filmów Marvela powraca do służby w T.A.R.C.Z.Y. Kieruje on niewielkim zespołem wyjątkowo sprawnych agentów, których zadaniem jest rozwiązywanie niezwykłych, często paranormalnych i skomplikowanych przypadków, których nie da się wpasować w standardowe procedury. Fabuła skupia się na badaniu zjawisk i zagrożeń, które wykraczają poza granice normalnego świata.